李宗霖博士
生物工程专业：硕士生导师
生物与医药专业（生物工程领域）：硕士生导师
个人简介:
华东理工大学生物工程学院，特聘副研究员。中国生物工程学会一碳生物技术专委会青年学者，上海市生物工程学会青年委员。入选上海市“超级博士后”激励计划（2023年）、国家资助博士后研究人员计划（2023年），获上海市“海聚英才”创新创业大赛决赛金奖（2025年）。
研究方向：生物催化磷酰基转移与能量分子工程
磷酰基转移反应是生命体系中最基础、最重要的化学转化之一，广泛参与能量传递、信号调控和物质代谢过程。课题组聚焦生物催化磷酰基转移与能量分子工程，围绕磷酸激酶及其他磷酰基转移酶的发现、改造与应用，研究NTP、聚磷酸及其他高能磷酸化合物的生成、转化与利用规律，构建高效能量供给体系和精准磷酰化平台。利用酶催化所具有的区域选择性和立体选择性优势，实现O–P、N–P、S–P和C–P键的高效构建，为核苷酸、糖基供体、活性天然产物及其他高值磷酸化化学品的绿色生物制造提供新策略。
主要研究课题包括：
（1）磷酰基转移酶的挖掘与创制
从自然界中发掘具有新功能和广谱底物适应性的磷酰基转移酶，结合AI设计、祖先序列重建等技术，提升酶的活性、稳定性和选择性，拓展生物催化磷酰基转移反应的应用范围。
（2）高能磷酸化合物与能量模块工程
围绕ATP、UTP、GTP、聚磷酸等关键能量分子，研究其生物合成、再生及能量耦合机制，开发低成本、高效率的能量再生体系和新型磷酰基供体，突破生物制造过程中能量供给受限的关键瓶颈。
（3）多酶级联与人工代谢网络构建
将磷酰基转移模块与其他生物催化模块组合，构建体外多酶分子机器和人工代谢网络，实现从廉价生物质到高值磷酸化化学品的高效绿色合成，推动从基础机制研究到产业化应用的转化。
主持的科研项目或基金
1. 国家重点研发计划青年科学家项目——2024.12-2027.11，子任务负责人
2. 中国石油科技创新基金研究项目——2025.03-2028.03，主持
3. 上海市科委2025年度关键技术研发计划合成生物学项目——2025.08-2028.07，子课题负责人
4. 国自然青年科学基金C——2026.01-2028.12，主持
部分发表论文：（#共同第一作者，*通讯作者）
1. Zong-lin Li*. 70 years of polyphosphate kinase: Expanding functions and emerging design considerations. ChemBioChem2026, 27, e70328.
2. Zong-lin Li#,*, Ting Chen#, Zhi-min Li*. Engineering the activity and stability of dCMP deaminase to achieve efficient and simple production of uridine monophosphate. Journal of Agricultural and Food Chemistry2025, 73: 29674–29682.
3. Xiao-peng Dai, Xiang-chun Meng, Ying-jun Zhou, Zhi-min Li*, Yu Ji*, Ulrich Schwaneberg, Zong-lin Li*. De Novo design of high-performance Sec-type signal peptide via a hybrid deep learning architecture. JACS Au2025, 5: 4669–4674.
4. Shuai Xu, Shu-hong Wang, Long-wei Lou, Yu Ji, Ulrich Schwaneberg, Zhi-min Li*, Feng Cheng*, Zong-lin Li*. Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol. Nature Communications2025, 16: 8079.
5. Shuai Xu, Ya-min Chen, Xiang-yu Meng, Ru Pan, Ao-xuan Yan, Zhi-min Li*, Zong-lin Li*. Computational-assisted protein engineering to develop thermostable and highly active catalase for industrial and biocatalytic applications. Bioresource Technology2025, 437: 133081.
6. Chuan-qi Sun, Zhi-min Li*, Yu Ji*, Ulrich Schwaneberg, Zong-lin Li*. CMDmpnn: combining comparative molecular dynamics and ProteinMPNN to rapidly expand enzyme substrate spectrum. Journal of Chemical Information and Modeling2025, 65: 2741–2747.
7. Shuai Xu#, Zong-lin Li#,*, Zhi-min Li*, Hong-lai Liu. Mining unique cysteine synthetases and computational study on thoroughly eliminating feedback inhibition through tunnel engineering. Protein Science2024, 33: e5160.
8. Chuan-qi Sun, Miao-zi Lou, Zong-lin Li*, Fei-yan Cheng, Zhi-min Li*. Combining an enhanced polyphosphate kinase-driven UDP-glucose regeneration system with the screening of key glycosyltransferases for efficient in vitro synthesis of nucleoside disaccharides. Journal of Agricultural and Food Chemistry2024, 72: 20557–20567.
9. Zong-lin Li#,*, Miao-zi Lou#, Chuan-qi Sun, Zhi-min Li*. Engineering a robust UDP-glucose pyrophosphorylase for enhanced biocatalytic synthesis via ProteinMPNN and ancestral sequence reconstruction. Journal of Agricultural and Food Chemistry2024, 72: 15284–15292.
10. Zong-lin Li#,*, Chuan-qi Sun#, Zhou-lei Qing, Zhi-min Li*, Hong-lai Liu. Engineering the thermal stability of a polyphosphate kinase by ancestral sequence reconstruction to expand the temperature boundary for an industrially applicable ATP regeneration system. Applied and Environmental Microbiology2024, 90: e01574-23.
本课题组的研究方针和基本思想
1、关于研究课题
我们对创造新事物（分子、系统、程序等）很感兴趣，尤其是利用进化论来创造新事物。一般来说我们会提出几个项目，并要求你从中选择最符合自身需求的项目，研究你感兴趣的领域。我们的研究涵盖化学、生物、计算科学。
2、关于研究指导
我们随时期待并欢迎与你就任何方面进行讨论。但是消极的态度很快就会结束对话。所有人需要注意，不要成为指令的发出者和接受者。我们的第一个目标是培养你逻辑思考和独立解决问题的能力。我们希望与学生建立起既是合作者又是成年人的关系（相互独立、相互扶持、保持分寸）。
3、关于发表论文
不发表论文等于什么都没做。我们重视科研诚信与学术规范，毕业要求严格。我们没有顶刊崇拜，但鼓励大胆尝试。无论学术型或专业型硕士，均须以第一作者发表JCR Q2及以上论文方可申请学位。发表论文需要遵循一定的礼仪，你需要快速掌握论文所需的研究和实验方法，经验至关重要。
4、关于其他事宜
我们的第二个目标是培养你学会安排自己的时间，平衡生活与科研，但禁止兼职。我们鼓励体育运动，身体健康永远是第一位。一般情况下寒/暑假均为15天，自行协调安排时间。路途遥远可增加1天。我们每周举行一次固定文献汇报组会，每月举行一次实验室全体会议。
最重要的是，带着微笑享受每一天
办公地点：徐汇校区实验十八楼 801 室
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