
郁惠蕾
生物化工专业:博士生导师/硕士生导师
生物工程专业:博士生导师/硕士生导师
生物与医药专业(生物工程领域):博士生导师/硕士生导师
个人简历
郁惠蕾,华东理工大学教授,博士生导师,国家优秀青年基金获得者,上海市优秀学术带头人。2008年获华东理工大学生物化工工学博士学位,入选全国百篇优秀博士论文提名;2008年入职生物反应器工程国家重点实验室;2013年6月至2014年6月于MIT化工系G. Stephanopoulos课题组从事访问学者研究。主要从事新酶的发现、设计和应用基础研究,聚焦“酶结构-功能关系及其调控规律”这一关键科学问题,建立了基于计算驱动和深度学习的酶分子设计策略,实现酶活性中心大范围协同突变的“功能重塑”和酶工业应用属性的“定向进化”;提出了底物靶向性的酶理性设计策略,构建了紫杉烷定点氧化、硫醚不对称氧化等非天然酶分子元件;基于反应过程调控的工业催化剂性能强化技术,实现了酶法合成手性亚砜和手性醇工艺的成果转化应用,促进了精细化学品生产技术的绿色革新。主持国家重点研发计划课题、国家自然科学优秀青年基金项目、上海市合成生物学重大专项、企业委托重大项目等20余项。累计发表SCI收录论文100余篇,包括在Nat. Commun. 、Science Advances、Agnew Chem. Int. Ed. 、ACS Catal等生物催化和生物化工领域期刊上发表论文;授权中国发明专利20余项,授权美国专利3项;主编教材《生物催化剂工程─原理及应用》入选国家重点出版规划,参编《手性物质化学学科战略研究报告》、《手性合成》第7版等著作。担任国际期刊Bioresources and Bioprocessing执行编辑和中央企业未来产业合成生物领域创新联合体专家咨询委员会委员。曾获霍英东基金(2012年)、上海市技术发明奖一等奖(2018年)、上海市教学成果二等奖(2022年)、首届中国酶工程新华扬优秀青年酶学家奖(2019年)、欧洲催化协会期刊ChemCatChem的“女性催化人物”(2019),上海市优秀学术带头人(2021年)、上海市优秀硕士论文指导教师等荣誉。
目前主要研究方向
l 新酶基因挖掘和理性设计方法开发
l 新型萜类羟化酶的发现和分子改造
l 系统生物催化合成重要精细化学品
科研项目
1. 国家重点研发课题 (2019YFA0905001,2021-2024,主持)
2. 国家基金委优青项目(21922804,2021-2023,主持)
3. 国家基金委面上项目(32271540,2023-2026,主持)
4. 国家重点研发课题 (2021YFC2102900,2021-2024,参与)
5. 上海市合成生物学重大专项(23HC1400200,2023-2026,主持)
6. 上海市学科带头人项目(21XD1400800,2021-2024,主持)
7. 企业委托项目 (若干,主持)
代表性论文
1. M. Y. Lai, Y. Weng, J. Wei, X.Y. Lu, Z.Y. Huang, H.C. Li, L.H. Huang, Z.J. Zhang, L.L. Zhu, J. H. Xu, R. Hong, H.-L. Yu*. Designing an oxidase toolbox for site-directed oxidation of taxanes. Nat. Commun. 2025, https://doi.org/10.1038/s41467-025-67544-4 (构建紫杉烷定点氧化的非天然酶分子元件,为开辟紫杉醇等复杂天然产物绿色生物合成的新路线奠定基础)
2. Y.-C. Zheng, Y. Mao, Q. Geng, F.-L. Li, X.-D. Kong, Y.-K. Qi, L. Zhang, Q. Chen, Z.-J. Zhang, R. Hong, Y.-L. Zhao,* H.-L. Yu,* and J.-H. Xu. Flipping of a non-productive substrate binding conformation facilitates hydroxynitrile lyase catalyzed hydrocyanation. Agnew Chem. Int. Ed. 2025, e202515778 (VIP,提出了通过调控底物通道内构象翻转来提升羟腈裂解酶催化效率,突破传统蛋白质工程领域主要聚焦活性中心几何优化的模式).
3. C. Zhao, Q. Geng, K. Shi, J. Pan, H.-L. Yu*. Reprogramming the catalytic pocket of Baeyer−Villiger monooxygenase for environmentally compatible synthesis of a chiral sulfoxide pharmaceutical. ACS Catal. 2025, 15, 17206-17214 (精准设计Baeyer–Villiger单加氧酶催化剂,实现手性亚砜药物右旋兰索拉唑的高效绿色合成).
4. Q. Geng, C.D. Zhou, Y.C. Zheng, F. Liu, Q. Chen, Z.J. Zhang, X.D. Kong, Z.K. Zhao, J.H. Xu, H.-L. Yu*. Hinge loop reconstruction facilitates hydride transfer in Baeyer-Villiger monooxygenases. Chem Catal. 2025, 5, 101364 (重塑铰链区Loop促进递氢 提升Baeyer–Villiger单加氧酶催化效率).
5. K. Shi#, J.-M. Li#, M.-Q. Wang, Y.-K. Zhang, Z.-J. Zhang, Q. Chen, F. Hollmann, J.-H. Xu, H.-L.Yu*. Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity. Sci. Adv. 2024. DOI: 10.1126/sciadv.adp6775 (构建了基于近攻击构象概率和酶底物结合能的物理模型,建立了计算驱动的羧酸还原酶高通量筛选方法).
6. J.-M. Li, K. Shi, A.-T. Li, Z.-J. Zhang*, H.-L. Yu *, J.-H. Xu. Development of a thermodynamically favorable multi-enzyme cascade reaction for efficient sustainable production of ω-amino fatty acids and α,ω-diamines. ChemSusChem, 2024, 17(6). DOI10.1002/cssc.202400204 (封面论文,构建多酶级联合成氨基脂肪酸和二元胺)
7. K. Shi, J.-M. Li, Z.-J. Zhang, Q. Chen, J.-H Xu, H.-L. Yu*. Virtual screening of carboxylic acid reductases for biocatalytic synthesis of 6-aminocaproic acid and 1,6-hexamethylenediamine. Biotechnol. Bioeng., 2023, 120: 1773-1783. (基于计算建模虚拟筛选羧酸还原酶用于生物合成己二胺)
8. Y.-Q. Wu, C.-C. Chen, Q. Chen, Q. Geng, Q.-Y. Zhang, Y.-C. Zheng, C. Zhao, Y. Zhang, J.-H. Zhou, B.-J. Wang*, J.-H. Xu *, H.-L. Yu *. Precise regulation of the substrate selectivity of Baeyer‐Villiger monooxygenase to minimize overoxidation of prazole sulfoxides. Chin. J. Catal., 2023, 51, 157-167 (揭示了影响硫醚/亚砜两种十分相似底物选择性的分子调控机制,有效解决了硫醚过氧化难控制的问题)
9. Y.-C. Zheng, F.-L. Li, Z.-M. Lin, G.-Q. Lin, R. Hong*, H.-L. Yu*, J.-H Xu* Structure-guided tuning of a hydroxynitrile lyase to accept rigid pharmaco aldehydes. ACS Catal., 2020, 10, 5757-5763. (基于结构微调设计可接受刚性药物中间体醛的羟氰裂解酶)
10. N. Xu, J. Zhu, Y.-Q. Wu, Y. Zhang, J.-Y. Xia, Q. Zhao, G.-Q. Lin, H.-L. Yu*, J.-H Xu*. Enzymatic preparation of the chiral (S)-sulfoxide drug esomeprazole at pilot scale levels. Org. Process Res. Dev., 2020, 24, 1124-1130. (首次实现了百升级规模抗胃溃疡药物艾司奥美拉唑的酶法生产)
11. Y. Zhang, Y.-Q. Wu, N. Xu, Q. Zhao, H.-L. Yu*, J.-H Xu. Engineering of cyclohexanone monooxygenase for the enantioselective synthesis of S-omeprazole, ACS Sustain. Chem. Eng., 2019, 7, 7218−7226. (采用分区重组酶聚焦进化方法创制人工拉唑硫醚单加氧酶)
12. F.-L. Li #, X.-D. Kong #, Q. Chen, Y.-C. Zheng, Q. Xu, F.-F. Chen, L.-Q. Fan, G.-Q. Lin, J.-H. Zhou*, H.-L. Yu*, J.-H. Xu*. Regioselectivity engineering of epoxide hydrolase: Near-perfect enantioconvergence through a single site mutation, ACS Catal., 2018, 8, 8314–8317 (成功靶向酶的区域选择性关键位点,构建完美对映归一性的环氧水解酶).
著作
1. 郁惠蕾, 许建和. 生物催化剂工程-原理及应用(第二版). 化工出版社. 2025. ISBN 978-7-122-47680-7
2. 许建和,郁惠蕾. 生物催化剂工程-原理及应用. 化工出版社. 2016. ISBN 978-7-122-25860.
3. 郁惠蕾, 许建和 译校 (许建和、陶军华、林国强 主译). 面向制药工业的生物催化—发现、开发及生产. 化学工业出版社. 2010
4. 许建和, 郁惠蕾. 生物催化法合成手性药物及中间体. 见:林国强、王梅祥 主编,《手性合成与手性药物》(第2章). 化学工业出版社. 2008
教学
1. 研究生全英文课程《Enzyme Technology and Biocatalysis》
2. 本科生必修课《应用生物催化与绿色制药》
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邮箱:huileiyu@ecust.edu.cn
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